Когда-то на месте настоящего исторического центра Арзамаса, находился пограничный город-крепость. И на его территории, согласно писцовым книгам 1620 года, стояла церковь в честь Воскресения Христова.
Есть сведения о том, что до революции в Воскресенском соборе хранились документы, доказывающие, что храм существовал еще в правление царя Федора Иоанновича. А по преданию, заложена была Воскресенская церковь еще во время Казанского похода его отца Ивана Грозного в 1552 году. Правда, освятили тогда храм в крепости в честь Михаила Архангела.
Известно, что в 1643 году церковь сгорела и через девять лет ее отстроили заново на том же месте, из дубовых бревен. Освятили во славу Воскресения Христова.
Храм был клетский, имел шатровое завершение, трапезную и небольшую колокольню.
Существует предание, что это церковное здание было потом продано в одно из сел арзамасской округи - в Водоватово, и что храм этот из Водоватова в начале XX века перевезли в деревню Костылиху, которая по причине появления церкви стала именоваться селом.
По другой версии, церковное здание перевезли в Костылиху сразу, когда начали строить каменный Воскресенский собор. Там оно стоит и по сей день. Но о прежнем облике мало что напоминает. Здание претерпело множество перестроек.
Возможно, в период с 1643 по 1742 годы в Арзамасе существовало два здания собора - одно за другим. Или же одновременно - летняя и зимняя церкви, - и одна из них потом оказалась в Костылихе.
Общеизвестно, что в 1726 году в городе случился страшный пожар, который уничтожил множество жилых домов, монастырские и храмовые постройки. Но храм на холме у склона высокого берега реки Теши огненная стихия пощадила. На соборной церкви в честь Воскресения Христова сгорела лишь крыша.
Видимо, повреждения были незначительные, поскольку только через два года, в 1728 году, начались работы по ремонту кровли. Николай Михайлович Щегольков пишет, что был «дан указ Спасскому архимандриту Иоасафу.»
Этим указом по челобитью соборного протопопа Степана Максимова с братиею повелевалось: «на соборной церкви, вместо сгорелой кровли построить вновь, а подле той соборной церкви, которая имеется, с алтарною стеною в равенстве построить придел во имя св. Иоанна Воинственника».
Воскресенский собор выстроили в камне в середине столетия - в 1742 году. Кроме главного здесь был освящен престол в честь мученика Иоанна Воина. В храме установили высокий пятиярусный иконостас. 11 июня 1787 года Воскресенский собор посетила Екатерина II, бывшая в Арзамасе проездом.